
České Budějovice jsou statutární město a správní i kulturní metropole Jihočeského kraje. Nachází se v něm řada muzeí a historických památek a jsou výchozím bodem k výletům po celém kraji.
Morový špitál se nachází na Pražské třídě směřující od centra města směrem na Tábor, Benešov a dál ku Praze.
Segmentová okna závěru jsou zazděna a interiér osvětlují okna v bočních zdech lodi. Vstup do kaple byl původně ze dvou samostatných vchodů, z nichž jižní s portálem vrcholícím tympanonem byl druhotně zazděn. Z kaple je přímý vstup do interiéru špitálu. Na ní navazuje gotické příčné (střední) křídlo špitálu a areál zakončuje souběžně s osou kaple orientované barokní severní křídlo s volutovým štítem na východní straně. Na štítě je odkryta část nástěnné malby. Západně přiléhá ke špitálu zahrada se studnou. V přízemních místnostech příčného křídla jsou zachované trámové stropy a v barokním severním křídle štukové zrcadlové stropy. K nejcennějším prvkům patří dochované barokní fresky v kapli od vynikajícího jihočeského rokokového malíře Františka Jakuba Prokyše (stropní fresky - andělé se symboly Nejsvětější Trojice, sv. Augustin, Abrahám se třemi mládenci a znak města Budějovic; na stěnách ornamentální fresky; na východní straně pak iluzivní freska, která doplňuje oltář, barokní od L. Huebera). Součástí výbavy byl od r. 1811 též deskový obraz Madony svatotrojické (nyní Alšova galerie na zámku v Hluboké nad Vltavou). V jedné místnosti rekonstruovaného špitálu bude komorní muzeum jeho historie a po rekonstrukci bude otevřena i kaple Nejsvětější Trojice..
V r. 1763 byla kaple zrenovována a částečně barokně přestavěna. O tři roky později byl barokně přestavěn i špitál a v r. 1779 bylo dostavěno barokní severní křídlo. V 19. století se ze špitálu stal chudobinec, který fungoval ještě krátce po r. 1948. Později se změnil na byty a kaple sloužila k občasným bohoslužbám až do r. 1971. Pozdější úpravy nezanechaly žádné podstatné architektonické změny a k tomu směřovala i rozsáhlá rekonstrukce v letech 1979-1981 a celková oprava průčelí v r. 2006. Nyní v obnoveném špitále sídlí pracoviště Národního památkového ústavu v Českých Budějovicích..