
Rozsáhlá jeskyně se rozkládá místy až na třech patrech. Nachází ve střední části Chráněné krajinné oblasti Moravský kras, v údolí Křtinského potoka, jímž byla vytvořena v masivu devonského vápence, který tvoří tuto oblast.
Je součástí turistické trasy (modré značení) z Adamova směrem k Býčí skále. Několikrát ročně se zde pořádají organizované prohlídky s průvodcem. Jinak jde o území národní přírodní rezervace, kde není pohyb mimo značené cesty povolen.
V období 13. století sloužila jako úkryt obyvatel z okolí před tatarskými vojsky plenícími zdejší oblast. V 19. stol. v ní žil poustevník Joachym, po kterém získala své jméno. Na počátku 20. století zde byly těženy fosfátové hlíny vzniklé z netopýřího trusu - guana - a kostí. Díky těžbě byla jeskyně vyčištěna a zvětšena. Při archeologickém výzkumu bylo v jeskyni nalezeno mnoho fosilních pozůstatků savců, z nichž světovým unikátem jsou kosterní pozůstatky zvířete Cuon europaeus, psovité šelmy podobné vlku. Dvě kostry tohoto zvířete jsou v Moravském muzeu v Brně..