
Jeskyně se nacházejí v Pustém žlebu, cca 1 km od infocentra Skalní mlýn. Byly objevovány v letech 1909–1933 pracovní skupinou soustředěnou okolo profesora Karla Absolona. Trasa vede mohutnými dómy a chodbami s krápníkovou výzdobou na dno světoznámé propasti Macocha. Hloubka propasti je 138,7 metru, ale fascinující jsou především její rozměry půdorysné - 174 x 76 metrů. Prohlídka pokračuje projížďkou na motorových člunech po podzemní říčce Punkvě, která jeskyně vyhloubila. Součástí plavby je prohlídka nejkrásnější jeskynní prostory v Moravském krasu - Masarykova dómu. Punkevní jeskyně navazují na nejdelší jeskynní systém České republiky - Amatérskou jeskyni, jejíž délka chodeb je přes 35 kilometrů.
Pro umožnění proplutí návštěvníků jeskyní na loďkách po řece Punkvě byla pracně vybudována cesta (odstřelení stropu, odčerpání vody atp.). Trasa vede několika patry jeskyně částečně po souši, částečně po vodě chodbami a mohutnými dómy s bohatou krápníkovou výzdobou. Suchá část byla zpřístupněna r. 1909, r. 1933 měli první návštěvníci možnost projet i vodní trasu. Dnes jsou Punkevní jeskyně nejnavštěvovanějším jeskynním systémem v ČR..