
Stavba dvora s tvrzi započala pravděpodobně již v roce 1570, kdy vlastníkem Otrokovic byl Burian Tetour z Tetova. Ale poprvé se připomíná až v roce 1576 za Bohuše Kokorského. V roce 1649 přešla do majetku Jana Rotala, majitele napajedelského panství. Ten přesídlil do Napajedel, tvrz ztratila svoji rezidenční funkci a po roce 1750 zanikla. Na jejím místě byla vybudována nejdříve sýpka a později i nová vrchnostenská obytná budova. Ta se poprvé uvádí v roce 1767 jako lovecký dům či zámeček. Na Napajedlech tehdy vládli Marie Anna rozená Rotalová a její manžel Quidobald Dietrichstejn. Byla to jednopatrová obdélníková budova krytá sedlovou střechou stávající v těsném sousedství sýpky.
V rámci pozemkové reformy v letech 1923-1926 přešel dvůr,sýpka i zámek do vlastnictví státu. V sedmdesátých letech 20. století byl celý areál zbořen z důvodu výstavby otrokovického sídliště. Na místě sýpky a zámku stojí dnes vinárna s názvem po bývalé sýpce..