
Kostel sv. Jana Křtitele stojí na Jánském kopečku ve Staré Jihlavě. MHD se k němu lze snadno dostat trolejbusy A a B nebo autobusem č. 4 (zastávka Pod Jánským kopečkem). Auto lze zaparkovat několik desítek metrů od kostela, přímo na úpatí Jánského kopečku. Kostel je přístupný při mších každou středu od 17.00 hodin, neděli od 08:00 hodin. Na svátek patrona kostela se zde konají mše česko-německého usmíření. Rovněž se zde čas od času konají koncerty. Pro skupiny lze dohodnout návštěvu kostela mimo termíny bohoslužeb na kontaktním e-mail či telefonu.
Do kostela vedou dva vchody: ze západu a z jihu; vedle jižního vchodu je zazděný hrotitý portál raně gotického vchodu. Na severní straně lodi jsou zazděná tři původní štěrbinová okna. Nad kněžištěm je čtyřboká dřevěná věžička. V interiéru se dochoval pozdně gotický sedlový portál a sedile. V roce 2008 byly restaurovány fresky po stranách vítězného oblouku a v roce 2009 vitráže oken jižní strany lodi..
První doložený patronát patřil řádu německých rytířů, od roku 1233 pak patřil želivským premonstrátům. Písemně je kostel poprvé uváděn roku 1243. Roku 1257 byla fara přenesena k sv. Jakubu Většímu v nově budovaném centru města. Jádro kostela je raně gotické z poloviny 13. století. Triumfální oblouk, presbytář s apsidou a vížkou vznikl před rokem 1270. Zajímavou teorii (i když podle novějších pramenů málo pravděpodobnou) je, že v té době byla loď předělena příčkou a zadní třetina sloužila k bydlení. Roku 1458 byl kostel poškozen vojsky Jiřího z Poděbrad. Při opravách vznikla síťová klenba presbytáře a sedlový portál do (tehdy dřevěné) sakristie. Za renesanční přestavby na samém počátku 17. století byla zvýšena loď, byly vytvořeny nové vchody s renesančními portály, byla vestavěna kruchta a na severu přistavena kamenná sakristie. Výrazně poškozen byl kostel během švédské okupace Jihlavy za třicetileté války. Po ní byl obnoven v barokním stylu. Tehdy mimo jiné vznikl vstup z kruchty na venkovní kazatelnu. Generální opravy kostela proběhly v letech 1905 a 1984..