
Gotický kostelík ze 13. století zasvěcen svatému Tomáši, kdy vznikla i obec stejného jména obývaná dřevaři a zemědělci. Po druhé světové válce byl Svatý Tomáš – stejně jako mnoho okolních obcí – vysídlen a v letech 1956–1958 byla zbořena většina domů, které nahradily nevzhledné komunistické bytovky, určené pro zaměstanance lesního závodu, důstojníky a mužstvo radarové stanice, jejíž pozorovatelna byla zřízena na věži Vítkova Kamene.
Po opravách kostela, loveckého zámečku a zříceniny hradu se Svatý Tomáš znovu probouzí a stavá se cílem řady turistů v oblasti Lipna a Šumavy.
na úbočí Vítkova kamene (300 m daleko) vzniklá pod rožmberským hradem. Kostel pochází z 1. pol. 14. století. Úpravy byly provedeny ještě v 16. století. V 90. letech 20. století byl rekonstruován. V současné době je nepřístupný. Zajímavostí je prezbytář s klenutou hvězdicovou klenbou a s motivem svázaných stromových kmenů. V hrotitých oknech jsou gotické kružby, z nich jedna je původní ze 14. století..
Sakristie na severní straně kostela je ovšem starší. Je románská a pochází údajně z kostela, který dal zbudovat roku 1258 Vítek z Krumlova. Na severní straně chóru je nástěnná malba ze 14. století, tedy z prvního gotického stavebního období. Tato malba byla objevena teprve před několika lety, kdy do kostela netěsnou a zdevastovanou střechou zatékalo a tím došlo k opadávání omítky. Malba zobrazuje Pannu Marii s Ježíškem a Tři krále. Roku 1991 byla zahájená renovace tehdy téměř rozpadlého kostela hrozícího zřícením..