
Gotická trojlodní bazilika z 15. století je 84 m dlouhá, 28 m vysoká a 34 m široká. Je to největší gotický kostel v Litvě. Kaple Nejsvětější svátosti, postavená v roce 1895, je rozšíření jižní lodi s vyřezávaným dřevěným nábytkem v novogotickém slohu. K dispozici je také novogotické mausoleum. Je zde pochován jeden z nejznámějších litevských romantických básníků Maironis. Papež František navštívil katedrálu 23. září 2018. Bazilika byla zahrnuta do rejstříku nemovitého kulturního dědictví UNESCO Litevské republiky v roce 1996.
Přesné datum, kdy byl první gotický kostel v Kaunasu zasvěcený sv. Petrovi a sv. Pavlovi postaven, není známo. Poprvé je zmíněn v písemných pramenech v roce 1413. První farní škola pří kostele sv. Petra a Pavla je zmíněna v roce 1473. Stavební práce byly ukončeny až v roce 1624. Kostel značně trpěl za války v roce 1655. V roce 1671 byl přestavěn a získal některé renesanční prvky. Pouze jedna z věží byla přestavěna po požáru střechy v roce 1732. V rámci rekonstrukce byla vnitřní výzdoba financována králem Stanislavem Poniatowským v roce 1771. Současná podoba budovy je z další rekonstrukce v roce 1800. Kostel byl povýšen na katedrálu papežem Lvem XIII. v roce 1895. Titul baziliky získal v roce 1926, kdy byla diecéze reorganizována na metropolitní arcidiecézi Kaunas papežem Piem XI.