
Samotný kostel je přístupný během bohoslužeb, které se konají pravidelně o nedělích od 9.30. V kaplance – budově na opačné straně nádvoří – funguje městské informační centrum se zoologickým museem a stálou expozicí výtvarných děl zdejšího rodáka Jiřího Koláře.
Požár Protivína roku 1676 kostel i špitál ušetřil. Po přenesení farnosti roku 1683 byla severně od svatyně postavena budova fary, která vytvořila další nádvoří, otevřené do zahrady. Komplex se bez větších změn dochoval dodnes, i když zejména na přelomu 19. a 20. století se uvažovalo o jeho radikální přestavbě. Jednolodní raně barokní kostel s pravoúhlým presbytářem se obrací do náměstí východním průčelím se štítem. Obě budovy (kaplanka a děkanství) uzavírají svými vždy dvěma křídly nádvoří po obou delších stranách kostela. V posledních letech byla jižní část areálu včetně kostela opravena a slouží zčásti veřejnosti..