První písemná zmínka o vsi je z roku 1250, kdy ji držel Mrákota z Chotýšan. Poté se na celé století z pramenů vytratila a znovu se s ní setkáváme až roku 1357, kdy jsou připomínáni příslušníci rytířského rodu z Chotýšan – bratři Mrákota Hlavatec, Mrákota Dlouhý a Jaroslav a jiní bratři Zachař a Rous. Jejich potomci drželi Chotýšany do počátku 15. století. Roku 1411 daroval Václav IV. Chotýšany s tvrzí jako vyšehradské manství Přibíkovi z Buřenic, roku 1418 byl statek z manství propuštěn. Roku 1440 je připomínán Jan z Chotýšan, roku 1475 panství vlastnil Štěpán z Vrchotic. V první třetině 16. století jsou zde připomínání Jeroným ze Skuhrova a Štilfrýd Lukavecký z Lukavce.
Po roce 1530 drželi Chotýšany bratři Mikuláš a Jan Chobotští z Ostředka, jejichž potomek Vilém Chobotský je roku 1621 pro velké dluhy musel prodat. Novým majitelem se stal Václav st. Věžník z Věžník, po jehož smrti připadl jeho synovi Friedrichovi. Po smrti Friedricha († 1663) přešly jeho statky na jeho dva syny, z nichž Chotýšany dostal starší Václav Jaroslav. Po něm je zdědil syn Jan František († 1727) a vnuk Jan Josef, který Chotýšany roku 1737 prodal. Novým majitelem se stal Arnošt František z Vrtby z votické větve tohoto hraběcího rodu. Zatímco Věžníkové ještě sídlili na staré tvrzi, Arnošt František si v jejím sousedství postavil nový zámek. Tvrz od té doby byla využívána ke správním a hospodářským účelům (pivovar a lihovar). Nástupci Arnošta Františka († 1750) byli jeho stejnojmenný syn († 1791) a vnuk Adam František († 1807), kterým tato větev vrtbovského rodu vymřela. Chotýšany zdědil František Josef Vratislav z Mitrovic, po jehož smrti roku 1849 drželi panství synové František Josef a Josef František. Po smrti Josefa Františka roku 1869 musel starší František Josef silně zadlužené panství prodat. V průběhu 19. století se majitelé statku několikrát změnili, po roce 1948 bylo panství zkonfiskováno rodu Langhamerů z Bíliny. Budovy byly předány k užívání národnímu výboru v Chotýšanech. Po roce 1989 byly budovy ve velmi zchátralém stavu vráceny potomkům původních majitelů. Dnes je majitelem objektů bývalé tvrze společnost Farm Chotýšany, za jejíhož vlastnictví bývalé panské sídlo bohužel nadále chátrá.Text: historie
1.3. 2008 - Zany