Jeskyně je tvořená vápenci středního triasu ve dvou úrovních. Je výsledkem korozivní a erozivní činnosti ponorných vod přitékajících od jihu v průběhu pliocénu. Jeskyni tvoří chodby, síně a dómy, které zdobí krápníky všech možných druhů. Návštěvníci mohou obdivovat bílé pagody, sintrová jezírka, nástěnné vodopády s narůžovělými záclonami (Gotický dóm) nebo Kamennou vázu ve Velkém dómu, která je ve znaku Harmanecké jeskyně. V některých částech jeskyně se nacházejí jezírka s vzácnými jeskynními perlami. Barva krápníkových útvarů je většinou bílá, místy přechází do žluta či hněda.
V jeskyni se vyskytuje celá řada druhů jeskynních netopýrů (jeskyně je jednou z nejvýznamnějších lokalit výskytu netopýrů na Slovensku), dosud byl pozorován výskyt 11 druhů netopýrů - dominantními jsou druhy netopýra velkého a netopýra východního, dále se zde vyskytují zástupci vrápence velkého, vrápence malého, netopýra vousatého, netopýra brvitého a dalších.Text: popis
26.11. 2013 - E.H. podle http://cs.wikipedia.org; http://www.ssj.sk