První písemná zmínka o obci Troubky pochází z roku 1348, v roce 1351 je nepřímo zmiňován i kostel, a to v zástavním listu z roku 1355. V době husitských válek měla farnost v Troubkách zaniknout, protože duchovní správa opustila obec. Tato událost se uvádí v obecní kronice a také v listině Ctibora Tovačovského z Cimburka z roku 1476. Další zprávy o farnosti nejsou, ale předpokládá se, že v 16. století obec podlehla vlivu příznivců Jednoty bratrské, která je v Troubkách zmiňována roku 1619. V 17. století byla obnovena katolická duchovní správa. Kostel sv. panny a mučednice Markéty existoval již před rokem 1672, kdy je o něm zmínka v přerovské děkanské matrice. Někdy v 18. století, zřejmě po požáru v roce 1738, byl kostel barokně přestavěn a rozšířen. V červenci 1870 bylo rozhodnuto o zbourání kostela a stavbě nového. Poslední mše se v něm konala 25. srpna 1870 a po ní začala demolice. Již následující den ve 14.00 hod. byl položen základní kámen nové stavby. 7. července 1872 byl nový kostel slavnostně vysvěcen. Kvůli špatnému stavu byla v roce 1931 stará klenba nahrazena novým železobetonovým stropem. Po povodních v roce 1997 byl kostel opraven a byl zmodernizován interiér. Po dalších povodních v roce 2010 byl kostel znovu opraven.
Text: historie
2.6. 2015 - Luděk Vláčil
Zdroje
http://farnosttroubky.cz, a další zdroje.